Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J7

SLC6A15, Sodium-dependent neutral amino acid transporter B(0)AT2, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A15Q9H2J7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC6A15Q9H2J7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC6A15Q9H2J7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC6A15Q9H2J7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC6A15Q9H2J7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC6A15Q9H2J7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC6A15Q9H2J7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC6A15Q9H2J7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC6A15Q9H2J7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC6A15Q9H2J7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC6A15Q9H2J7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC6A15Q9H2J7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC6A15Q9H2J7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC6A15Q9H2J7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC6A15Q9H2J7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC6A15Q9H2J7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC6A15Q9H2J7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC6A15Q9H2J7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC6A15Q9H2J7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC6A15Q9H2J7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC6A15Q9H2J7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC6A15Q9H2J7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC6A15Q9H2J7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC6A15Q9H2J7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC6A15Q9H2J7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC6A15Q9H2J7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC6A15Q9H2J7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC6A15Q9H2J7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC6A15Q9H2J7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC6A15Q9H2J7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC6A15Q9H2J7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC6A15Q9H2J7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC6A15Q9H2J7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC6A15Q9H2J7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC6A15Q9H2J7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC6A15Q9H2J7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC6A15Q9H2J7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC6A15Q9H2J7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC6A15Q9H2J7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC6A15Q9H2J7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A15Q9H2J7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms