Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1D9

POLR3F, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3FQ9H1D9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
POLR3FQ9H1D9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
POLR3FQ9H1D9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR3FQ9H1D9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR3FQ9H1D9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR3FQ9H1D9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR3FQ9H1D9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR3FQ9H1D9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR3FQ9H1D9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR3FQ9H1D9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR3FQ9H1D9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR3FQ9H1D9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR3FQ9H1D9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR3FQ9H1D9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR3FQ9H1D9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR3FQ9H1D9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR3FQ9H1D9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR3FQ9H1D9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR3FQ9H1D9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR3FQ9H1D9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR3FQ9H1D9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR3FQ9H1D9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR3FQ9H1D9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR3FQ9H1D9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR3FQ9H1D9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR3FQ9H1D9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR3FQ9H1D9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR3FQ9H1D9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR3FQ9H1D9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR3FQ9H1D9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR3FQ9H1D9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR3FQ9H1D9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR3FQ9H1D9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR3FQ9H1D9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR3FQ9H1D9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR3FQ9H1D9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR3FQ9H1D9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR3FQ9H1D9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR3FQ9H1D9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR3FQ9H1D9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR3FQ9H1D9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR3FQ9H1D9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR3FQ9H1D9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR3FQ9H1D9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR3FQ9H1D9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR3FQ9H1D9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR3FQ9H1D9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR3FQ9H1D9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR3FQ9H1D9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR3FQ9H1D9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR3FQ9H1D9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR3FQ9H1D9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR3FQ9H1D9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR3FQ9H1D9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR3FQ9H1D9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR3FQ9H1D9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR3FQ9H1D9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR3FQ9H1D9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR3FQ9H1D9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR3FQ9H1D9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR3FQ9H1D9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR3FQ9H1D9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR3FQ9H1D9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3FQ9H1D9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3FQ9H1D9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3FQ9H1D9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3FQ9H1D9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3FQ9H1D9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3FQ9H1D9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3FQ9H1D9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3FQ9H1D9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3FQ9H1D9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3FQ9H1D9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3FQ9H1D9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR3FQ9H1D9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3FQ9H1D9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3FQ9H1D9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3FQ9H1D9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3FQ9H1D9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3FQ9H1D9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3FQ9H1D9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3FQ9H1D9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3FQ9H1D9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3FQ9H1D9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3FQ9H1D9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3FQ9H1D9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3FQ9H1D9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR3FQ9H1D9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR3FQ9H1D9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR3FQ9H1D9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR3FQ9H1D9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR3FQ9H1D9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR3FQ9H1D9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR3FQ9H1D9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR3FQ9H1D9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR3FQ9H1D9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR3FQ9H1D9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR3FQ9H1D9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR3FQ9H1D9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR3FQ9H1D9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.6 ms