Protein–RNA interactions for Protein: Q9H173

SIL1, Nucleotide exchange factor SIL1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIL1Q9H173 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIL1Q9H173 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIL1Q9H173 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIL1Q9H173 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIL1Q9H173 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SIL1Q9H173 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SIL1Q9H173 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SIL1Q9H173 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SIL1Q9H173 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SIL1Q9H173 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SIL1Q9H173 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SIL1Q9H173 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SIL1Q9H173 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SIL1Q9H173 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SIL1Q9H173 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIL1Q9H173 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIL1Q9H173 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIL1Q9H173 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIL1Q9H173 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIL1Q9H173 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIL1Q9H173 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIL1Q9H173 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIL1Q9H173 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIL1Q9H173 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIL1Q9H173 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIL1Q9H173 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SIL1Q9H173 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIL1Q9H173 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIL1Q9H173 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIL1Q9H173 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIL1Q9H173 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIL1Q9H173 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIL1Q9H173 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIL1Q9H173 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIL1Q9H173 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIL1Q9H173 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIL1Q9H173 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIL1Q9H173 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIL1Q9H173 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIL1Q9H173 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIL1Q9H173 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIL1Q9H173 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIL1Q9H173 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIL1Q9H173 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIL1Q9H173 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIL1Q9H173 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SIL1Q9H173 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SIL1Q9H173 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SIL1Q9H173 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms