Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0H3

KLHL25, Kelch-like protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL25Q9H0H3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
KLHL25Q9H0H3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL25Q9H0H3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL25Q9H0H3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms