Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP44Q9H0E7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP44Q9H0E7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP44Q9H0E7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
USP44Q9H0E7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
USP44Q9H0E7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
USP44Q9H0E7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP44Q9H0E7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP44Q9H0E7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP44Q9H0E7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP44Q9H0E7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP44Q9H0E7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP44Q9H0E7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP44Q9H0E7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP44Q9H0E7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP44Q9H0E7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP44Q9H0E7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP44Q9H0E7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP44Q9H0E7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP44Q9H0E7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP44Q9H0E7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP44Q9H0E7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP44Q9H0E7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP44Q9H0E7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP44Q9H0E7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP44Q9H0E7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP44Q9H0E7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP44Q9H0E7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP44Q9H0E7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP44Q9H0E7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP44Q9H0E7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP44Q9H0E7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP44Q9H0E7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP44Q9H0E7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP44Q9H0E7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP44Q9H0E7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP44Q9H0E7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP44Q9H0E7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP44Q9H0E7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP44Q9H0E7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP44Q9H0E7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
USP44Q9H0E7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP44Q9H0E7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP44Q9H0E7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP44Q9H0E7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP44Q9H0E7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP44Q9H0E7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP44Q9H0E7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP44Q9H0E7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP44Q9H0E7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP44Q9H0E7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP44Q9H0E7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP44Q9H0E7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP44Q9H0E7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP44Q9H0E7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP44Q9H0E7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP44Q9H0E7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP44Q9H0E7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP44Q9H0E7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP44Q9H0E7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP44Q9H0E7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP44Q9H0E7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP44Q9H0E7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP44Q9H0E7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP44Q9H0E7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP44Q9H0E7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP44Q9H0E7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP44Q9H0E7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP44Q9H0E7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP44Q9H0E7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP44Q9H0E7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP44Q9H0E7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP44Q9H0E7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP44Q9H0E7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP44Q9H0E7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP44Q9H0E7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP44Q9H0E7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
USP44Q9H0E7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP44Q9H0E7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP44Q9H0E7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP44Q9H0E7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP44Q9H0E7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP44Q9H0E7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP44Q9H0E7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP44Q9H0E7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP44Q9H0E7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP44Q9H0E7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP44Q9H0E7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP44Q9H0E7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP44Q9H0E7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP44Q9H0E7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP44Q9H0E7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP44Q9H0E7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP44Q9H0E7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP44Q9H0E7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP44Q9H0E7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP44Q9H0E7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP44Q9H0E7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
USP44Q9H0E7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP44Q9H0E7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms