Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PDGFDQ9GZP0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDGFDQ9GZP0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDGFDQ9GZP0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDGFDQ9GZP0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PDGFDQ9GZP0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PDGFDQ9GZP0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDGFDQ9GZP0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDGFDQ9GZP0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDGFDQ9GZP0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDGFDQ9GZP0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDGFDQ9GZP0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDGFDQ9GZP0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDGFDQ9GZP0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDGFDQ9GZP0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDGFDQ9GZP0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDGFDQ9GZP0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDGFDQ9GZP0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDGFDQ9GZP0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDGFDQ9GZP0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDGFDQ9GZP0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDGFDQ9GZP0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDGFDQ9GZP0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDGFDQ9GZP0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDGFDQ9GZP0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDGFDQ9GZP0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PDGFDQ9GZP0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDGFDQ9GZP0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDGFDQ9GZP0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDGFDQ9GZP0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDGFDQ9GZP0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDGFDQ9GZP0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDGFDQ9GZP0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PDGFDQ9GZP0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PDGFDQ9GZP0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDGFDQ9GZP0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDGFDQ9GZP0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDGFDQ9GZP0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDGFDQ9GZP0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDGFDQ9GZP0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PDGFDQ9GZP0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDGFDQ9GZP0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDGFDQ9GZP0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDGFDQ9GZP0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PDGFDQ9GZP0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDGFDQ9GZP0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDGFDQ9GZP0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDGFDQ9GZP0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDGFDQ9GZP0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDGFDQ9GZP0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms