Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LNPKQ9C0E8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LNPKQ9C0E8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LNPKQ9C0E8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LNPKQ9C0E8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LNPKQ9C0E8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LNPKQ9C0E8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LNPKQ9C0E8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LNPKQ9C0E8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LNPKQ9C0E8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LNPKQ9C0E8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LNPKQ9C0E8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LNPKQ9C0E8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LNPKQ9C0E8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LNPKQ9C0E8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LNPKQ9C0E8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LNPKQ9C0E8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LNPKQ9C0E8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LNPKQ9C0E8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LNPKQ9C0E8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LNPKQ9C0E8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LNPKQ9C0E8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LNPKQ9C0E8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LNPKQ9C0E8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LNPKQ9C0E8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LNPKQ9C0E8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LNPKQ9C0E8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LNPKQ9C0E8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LNPKQ9C0E8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LNPKQ9C0E8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LNPKQ9C0E8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LNPKQ9C0E8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LNPKQ9C0E8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LNPKQ9C0E8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LNPKQ9C0E8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LNPKQ9C0E8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LNPKQ9C0E8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LNPKQ9C0E8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LNPKQ9C0E8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LNPKQ9C0E8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LNPKQ9C0E8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LNPKQ9C0E8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LNPKQ9C0E8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms