Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CIPCQ9C0C6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CIPCQ9C0C6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 389.4 ms