Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NIFKQ9BYG3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NIFKQ9BYG3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NIFKQ9BYG3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NIFKQ9BYG3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NIFKQ9BYG3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NIFKQ9BYG3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NIFKQ9BYG3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NIFKQ9BYG3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NIFKQ9BYG3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NIFKQ9BYG3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NIFKQ9BYG3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NIFKQ9BYG3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NIFKQ9BYG3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NIFKQ9BYG3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NIFKQ9BYG3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NIFKQ9BYG3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NIFKQ9BYG3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NIFKQ9BYG3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NIFKQ9BYG3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NIFKQ9BYG3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NIFKQ9BYG3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NIFKQ9BYG3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NIFKQ9BYG3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NIFKQ9BYG3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NIFKQ9BYG3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NIFKQ9BYG3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NIFKQ9BYG3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NIFKQ9BYG3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NIFKQ9BYG3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NIFKQ9BYG3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NIFKQ9BYG3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NIFKQ9BYG3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NIFKQ9BYG3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NIFKQ9BYG3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NIFKQ9BYG3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NIFKQ9BYG3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NIFKQ9BYG3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NIFKQ9BYG3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NIFKQ9BYG3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NIFKQ9BYG3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NIFKQ9BYG3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms