Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY67

CADM1, Cell adhesion molecule 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM1Q9BY67 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CADM1Q9BY67 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CADM1Q9BY67 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CADM1Q9BY67 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CADM1Q9BY67 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CADM1Q9BY67 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CADM1Q9BY67 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CADM1Q9BY67 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CADM1Q9BY67 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CADM1Q9BY67 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CADM1Q9BY67 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CADM1Q9BY67 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CADM1Q9BY67 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CADM1Q9BY67 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CADM1Q9BY67 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CADM1Q9BY67 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CADM1Q9BY67 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CADM1Q9BY67 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CADM1Q9BY67 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CADM1Q9BY67 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CADM1Q9BY67 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CADM1Q9BY67 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CADM1Q9BY67 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CADM1Q9BY67 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CADM1Q9BY67 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CADM1Q9BY67 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CADM1Q9BY67 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CADM1Q9BY67 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CADM1Q9BY67 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CADM1Q9BY67 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CADM1Q9BY67 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CADM1Q9BY67 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CADM1Q9BY67 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CADM1Q9BY67 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CADM1Q9BY67 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CADM1Q9BY67 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CADM1Q9BY67 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CADM1Q9BY67 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms