Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VN1R3Q9BXE9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VN1R3Q9BXE9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VN1R3Q9BXE9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VN1R3Q9BXE9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VN1R3Q9BXE9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VN1R3Q9BXE9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VN1R3Q9BXE9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VN1R3Q9BXE9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VN1R3Q9BXE9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VN1R3Q9BXE9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VN1R3Q9BXE9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VN1R3Q9BXE9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VN1R3Q9BXE9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VN1R3Q9BXE9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VN1R3Q9BXE9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VN1R3Q9BXE9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VN1R3Q9BXE9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VN1R3Q9BXE9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VN1R3Q9BXE9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VN1R3Q9BXE9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VN1R3Q9BXE9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VN1R3Q9BXE9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VN1R3Q9BXE9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VN1R3Q9BXE9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VN1R3Q9BXE9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
VN1R3Q9BXE9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VN1R3Q9BXE9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
VN1R3Q9BXE9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VN1R3Q9BXE9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
VN1R3Q9BXE9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VN1R3Q9BXE9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VN1R3Q9BXE9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VN1R3Q9BXE9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VN1R3Q9BXE9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms