Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXB1

LGR4, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR4Q9BXB1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LGR4Q9BXB1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGR4Q9BXB1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGR4Q9BXB1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms