Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSM14BQ9BX40 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LSM14BQ9BX40 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms