Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RIOK2Q9BVS4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms