Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PBDC1Q9BVG4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PBDC1Q9BVG4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PBDC1Q9BVG4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PBDC1Q9BVG4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PBDC1Q9BVG4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PBDC1Q9BVG4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PBDC1Q9BVG4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms