Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV94

EDEM2, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM2Q9BV94 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDEM2Q9BV94 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDEM2Q9BV94 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDEM2Q9BV94 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDEM2Q9BV94 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDEM2Q9BV94 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDEM2Q9BV94 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDEM2Q9BV94 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EDEM2Q9BV94 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDEM2Q9BV94 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDEM2Q9BV94 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDEM2Q9BV94 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDEM2Q9BV94 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDEM2Q9BV94 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDEM2Q9BV94 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDEM2Q9BV94 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDEM2Q9BV94 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDEM2Q9BV94 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDEM2Q9BV94 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDEM2Q9BV94 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDEM2Q9BV94 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDEM2Q9BV94 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDEM2Q9BV94 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EDEM2Q9BV94 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EDEM2Q9BV94 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDEM2Q9BV94 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms