Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms