Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCMBPQ9BTE3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCMBPQ9BTE3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCMBPQ9BTE3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCMBPQ9BTE3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCMBPQ9BTE3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCMBPQ9BTE3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCMBPQ9BTE3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCMBPQ9BTE3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCMBPQ9BTE3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCMBPQ9BTE3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCMBPQ9BTE3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCMBPQ9BTE3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCMBPQ9BTE3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCMBPQ9BTE3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCMBPQ9BTE3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCMBPQ9BTE3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCMBPQ9BTE3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCMBPQ9BTE3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCMBPQ9BTE3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCMBPQ9BTE3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCMBPQ9BTE3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCMBPQ9BTE3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCMBPQ9BTE3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MCMBPQ9BTE3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCMBPQ9BTE3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCMBPQ9BTE3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCMBPQ9BTE3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MCMBPQ9BTE3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCMBPQ9BTE3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCMBPQ9BTE3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCMBPQ9BTE3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCMBPQ9BTE3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCMBPQ9BTE3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCMBPQ9BTE3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MCMBPQ9BTE3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MCMBPQ9BTE3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCMBPQ9BTE3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCMBPQ9BTE3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCMBPQ9BTE3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCMBPQ9BTE3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCMBPQ9BTE3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCMBPQ9BTE3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCMBPQ9BTE3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCMBPQ9BTE3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCMBPQ9BTE3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCMBPQ9BTE3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCMBPQ9BTE3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MCMBPQ9BTE3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCMBPQ9BTE3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCMBPQ9BTE3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCMBPQ9BTE3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms