Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COPS4Q9BT78 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COPS4Q9BT78 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COPS4Q9BT78 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
COPS4Q9BT78 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
COPS4Q9BT78 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPS4Q9BT78 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COPS4Q9BT78 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COPS4Q9BT78 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COPS4Q9BT78 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COPS4Q9BT78 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COPS4Q9BT78 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COPS4Q9BT78 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPS4Q9BT78 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPS4Q9BT78 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPS4Q9BT78 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPS4Q9BT78 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPS4Q9BT78 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPS4Q9BT78 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
COPS4Q9BT78 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
COPS4Q9BT78 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
COPS4Q9BT78 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPS4Q9BT78 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPS4Q9BT78 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPS4Q9BT78 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPS4Q9BT78 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COPS4Q9BT78 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COPS4Q9BT78 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COPS4Q9BT78 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COPS4Q9BT78 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COPS4Q9BT78 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
COPS4Q9BT78 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COPS4Q9BT78 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COPS4Q9BT78 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COPS4Q9BT78 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COPS4Q9BT78 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms