Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HERPUD2Q9BSE4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERPUD2Q9BSE4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms