Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS31

ZNF649, Zinc finger protein 649, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF649Q9BS31 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF649Q9BS31 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF649Q9BS31 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms