Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC39A3Q9BRY0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms