Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRQ0

PYGO2, Pygopus homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGO2Q9BRQ0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PYGO2Q9BRQ0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PYGO2Q9BRQ0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PYGO2Q9BRQ0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PYGO2Q9BRQ0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PYGO2Q9BRQ0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PYGO2Q9BRQ0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PYGO2Q9BRQ0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PYGO2Q9BRQ0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PYGO2Q9BRQ0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PYGO2Q9BRQ0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PYGO2Q9BRQ0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PYGO2Q9BRQ0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PYGO2Q9BRQ0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PYGO2Q9BRQ0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PYGO2Q9BRQ0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PYGO2Q9BRQ0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PYGO2Q9BRQ0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PYGO2Q9BRQ0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PYGO2Q9BRQ0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PYGO2Q9BRQ0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PYGO2Q9BRQ0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PYGO2Q9BRQ0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PYGO2Q9BRQ0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PYGO2Q9BRQ0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PYGO2Q9BRQ0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PYGO2Q9BRQ0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PYGO2Q9BRQ0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGO2Q9BRQ0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGO2Q9BRQ0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGO2Q9BRQ0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGO2Q9BRQ0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGO2Q9BRQ0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGO2Q9BRQ0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PYGO2Q9BRQ0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms