Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TXNDC17Q9BRA2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TXNDC17Q9BRA2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms