Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RHOXF2Q9BQY4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RHOXF2Q9BQY4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHOXF2Q9BQY4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms