Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCF25Q9BQ70 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCF25Q9BQ70 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms