Protein–RNA interactions for Protein: Q99720

SIGMAR1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1Q99720 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIGMAR1Q99720 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SIGMAR1Q99720 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIGMAR1Q99720 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms