Protein–RNA interactions for Protein: Q99578

RIT2, GTP-binding protein Rit2, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIT2Q99578 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIT2Q99578 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIT2Q99578 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIT2Q99578 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIT2Q99578 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIT2Q99578 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIT2Q99578 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIT2Q99578 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIT2Q99578 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIT2Q99578 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIT2Q99578 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RIT2Q99578 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIT2Q99578 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIT2Q99578 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIT2Q99578 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIT2Q99578 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIT2Q99578 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIT2Q99578 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIT2Q99578 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIT2Q99578 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIT2Q99578 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIT2Q99578 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIT2Q99578 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIT2Q99578 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIT2Q99578 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIT2Q99578 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIT2Q99578 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIT2Q99578 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIT2Q99578 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIT2Q99578 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIT2Q99578 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RIT2Q99578 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIT2Q99578 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIT2Q99578 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIT2Q99578 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIT2Q99578 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIT2Q99578 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIT2Q99578 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RIT2Q99578 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIT2Q99578 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIT2Q99578 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIT2Q99578 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIT2Q99578 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIT2Q99578 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIT2Q99578 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIT2Q99578 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RIT2Q99578 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIT2Q99578 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RIT2Q99578 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RIT2Q99578 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RIT2Q99578 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms