Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP4Q99569 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms