Protein–RNA interactions for Protein: Q99456

KRT12, Keratin, type I cytoskeletal 12, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT12Q99456 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT12Q99456 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT12Q99456 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT12Q99456 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms