Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMG1Q96Q15 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMG1Q96Q15 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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