Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GBP4Q96PP9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GBP4Q96PP9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms