Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPR78Q96P69 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPR78Q96P69 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms