Protein–RNA interactions for Protein: Q96P48

ARAP1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAP1Q96P48 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
ARAP1Q96P48 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
ARAP1Q96P48 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
ARAP1Q96P48 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
ARAP1Q96P48 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
ARAP1Q96P48 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
ARAP1Q96P48 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
ARAP1Q96P48 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.57
ARAP1Q96P48 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
ARAP1Q96P48 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
ARAP1Q96P48 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
ARAP1Q96P48 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
ARAP1Q96P48 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
ARAP1Q96P48 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
ARAP1Q96P48 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
ARAP1Q96P48 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
ARAP1Q96P48 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ARAP1Q96P48 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ARAP1Q96P48 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ARAP1Q96P48 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ARAP1Q96P48 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ARAP1Q96P48 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ARAP1Q96P48 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ARAP1Q96P48 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ARAP1Q96P48 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ARAP1Q96P48 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ARAP1Q96P48 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ARAP1Q96P48 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ARAP1Q96P48 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ARAP1Q96P48 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ARAP1Q96P48 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ARAP1Q96P48 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
ARAP1Q96P48 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ARAP1Q96P48 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ARAP1Q96P48 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ARAP1Q96P48 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
ARAP1Q96P48 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
ARAP1Q96P48 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ARAP1Q96P48 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ARAP1Q96P48 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ARAP1Q96P48 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
ARAP1Q96P48 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
ARAP1Q96P48 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
ARAP1Q96P48 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
ARAP1Q96P48 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
ARAP1Q96P48 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
ARAP1Q96P48 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
ARAP1Q96P48 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
ARAP1Q96P48 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
ARAP1Q96P48 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
ARAP1Q96P48 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
ARAP1Q96P48 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ARAP1Q96P48 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ARAP1Q96P48 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ARAP1Q96P48 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ARAP1Q96P48 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ARAP1Q96P48 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ARAP1Q96P48 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ARAP1Q96P48 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
ARAP1Q96P48 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
ARAP1Q96P48 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
ARAP1Q96P48 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
ARAP1Q96P48 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
ARAP1Q96P48 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
ARAP1Q96P48 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
ARAP1Q96P48 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
ARAP1Q96P48 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
ARAP1Q96P48 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
ARAP1Q96P48 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC37.21■■■■□ 3.55
ARAP1Q96P48 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
ARAP1Q96P48 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
ARAP1Q96P48 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
ARAP1Q96P48 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
ARAP1Q96P48 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
ARAP1Q96P48 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC37.2■■■■□ 3.55
ARAP1Q96P48 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
ARAP1Q96P48 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC37.2■■■■□ 3.54
ARAP1Q96P48 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC37.2■■■■□ 3.54
ARAP1Q96P48 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.54
ARAP1Q96P48 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.54
ARAP1Q96P48 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
ARAP1Q96P48 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
ARAP1Q96P48 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
ARAP1Q96P48 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
ARAP1Q96P48 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
ARAP1Q96P48 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
ARAP1Q96P48 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
ARAP1Q96P48 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
ARAP1Q96P48 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
ARAP1Q96P48 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
ARAP1Q96P48 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
ARAP1Q96P48 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
ARAP1Q96P48 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
ARAP1Q96P48 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
ARAP1Q96P48 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
ARAP1Q96P48 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
ARAP1Q96P48 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
ARAP1Q96P48 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
ARAP1Q96P48 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
ARAP1Q96P48 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms