Protein–RNA interactions for Protein: Q96NZ1

FOXN4, Forkhead box protein N4, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN4Q96NZ1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXN4Q96NZ1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXN4Q96NZ1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXN4Q96NZ1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXN4Q96NZ1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXN4Q96NZ1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXN4Q96NZ1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXN4Q96NZ1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXN4Q96NZ1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXN4Q96NZ1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXN4Q96NZ1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXN4Q96NZ1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXN4Q96NZ1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXN4Q96NZ1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXN4Q96NZ1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXN4Q96NZ1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXN4Q96NZ1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXN4Q96NZ1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXN4Q96NZ1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXN4Q96NZ1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXN4Q96NZ1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXN4Q96NZ1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXN4Q96NZ1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXN4Q96NZ1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXN4Q96NZ1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXN4Q96NZ1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXN4Q96NZ1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXN4Q96NZ1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXN4Q96NZ1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXN4Q96NZ1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXN4Q96NZ1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXN4Q96NZ1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXN4Q96NZ1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXN4Q96NZ1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXN4Q96NZ1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXN4Q96NZ1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXN4Q96NZ1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXN4Q96NZ1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXN4Q96NZ1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FOXN4Q96NZ1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FOXN4Q96NZ1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXN4Q96NZ1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms