Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RDH12Q96NR8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
RDH12Q96NR8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms