Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SCLT1Q96NL6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCLT1Q96NL6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCLT1Q96NL6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SCLT1Q96NL6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCLT1Q96NL6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCLT1Q96NL6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCLT1Q96NL6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SCLT1Q96NL6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCLT1Q96NL6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCLT1Q96NL6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SCLT1Q96NL6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCLT1Q96NL6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCLT1Q96NL6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCLT1Q96NL6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCLT1Q96NL6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCLT1Q96NL6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCLT1Q96NL6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCLT1Q96NL6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCLT1Q96NL6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SCLT1Q96NL6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCLT1Q96NL6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCLT1Q96NL6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCLT1Q96NL6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCLT1Q96NL6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCLT1Q96NL6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCLT1Q96NL6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCLT1Q96NL6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCLT1Q96NL6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCLT1Q96NL6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCLT1Q96NL6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCLT1Q96NL6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCLT1Q96NL6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCLT1Q96NL6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCLT1Q96NL6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCLT1Q96NL6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCLT1Q96NL6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCLT1Q96NL6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCLT1Q96NL6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms