Protein–RNA interactions for Protein: Q96N77

ZNF641, Zinc finger protein 641, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF641Q96N77 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF641Q96N77 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF641Q96N77 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF641Q96N77 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF641Q96N77 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF641Q96N77 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF641Q96N77 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF641Q96N77 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF641Q96N77 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF641Q96N77 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF641Q96N77 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF641Q96N77 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF641Q96N77 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF641Q96N77 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF641Q96N77 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF641Q96N77 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF641Q96N77 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF641Q96N77 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF641Q96N77 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF641Q96N77 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF641Q96N77 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF641Q96N77 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF641Q96N77 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF641Q96N77 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms