Protein–RNA interactions for Protein: Q96MS0

ROBO3, Roundabout homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO3Q96MS0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ROBO3Q96MS0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ROBO3Q96MS0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ROBO3Q96MS0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ROBO3Q96MS0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ROBO3Q96MS0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ROBO3Q96MS0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ROBO3Q96MS0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ROBO3Q96MS0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ROBO3Q96MS0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ROBO3Q96MS0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ROBO3Q96MS0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ROBO3Q96MS0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ROBO3Q96MS0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ROBO3Q96MS0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ROBO3Q96MS0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ROBO3Q96MS0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ROBO3Q96MS0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ROBO3Q96MS0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ROBO3Q96MS0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ROBO3Q96MS0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ROBO3Q96MS0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ROBO3Q96MS0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ROBO3Q96MS0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ROBO3Q96MS0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ROBO3Q96MS0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ROBO3Q96MS0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ROBO3Q96MS0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ROBO3Q96MS0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ROBO3Q96MS0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ROBO3Q96MS0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ROBO3Q96MS0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ROBO3Q96MS0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ROBO3Q96MS0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ROBO3Q96MS0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ROBO3Q96MS0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ROBO3Q96MS0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ROBO3Q96MS0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ROBO3Q96MS0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ROBO3Q96MS0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ROBO3Q96MS0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ROBO3Q96MS0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ROBO3Q96MS0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ROBO3Q96MS0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ROBO3Q96MS0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ROBO3Q96MS0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ROBO3Q96MS0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ROBO3Q96MS0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms