Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NSMCE2Q96MF7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
NSMCE2Q96MF7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NSMCE2Q96MF7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 812.4 ms