Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL15Q96M94 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL15Q96M94 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL15Q96M94 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL15Q96M94 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL15Q96M94 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL15Q96M94 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL15Q96M94 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL15Q96M94 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL15Q96M94 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL15Q96M94 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL15Q96M94 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL15Q96M94 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL15Q96M94 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL15Q96M94 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL15Q96M94 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL15Q96M94 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL15Q96M94 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL15Q96M94 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL15Q96M94 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL15Q96M94 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL15Q96M94 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL15Q96M94 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms