Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC138Q96M89 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC138Q96M89 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms