Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC114Q96M63 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC114Q96M63 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms