Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SUSD3Q96L08 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms