Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPZA3Q96KX2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.4 ms