Protein–RNA interactions for Protein: Q96KQ4

PPP1R13B, Apoptosis-stimulating of p53 protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R13BQ96KQ4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP1R13BQ96KQ4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP1R13BQ96KQ4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP1R13BQ96KQ4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP1R13BQ96KQ4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP1R13BQ96KQ4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP1R13BQ96KQ4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP1R13BQ96KQ4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP1R13BQ96KQ4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP1R13BQ96KQ4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP1R13BQ96KQ4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP1R13BQ96KQ4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP1R13BQ96KQ4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R13BQ96KQ4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R13BQ96KQ4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R13BQ96KQ4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R13BQ96KQ4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R13BQ96KQ4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R13BQ96KQ4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R13BQ96KQ4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R13BQ96KQ4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R13BQ96KQ4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R13BQ96KQ4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP1R13BQ96KQ4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP1R13BQ96KQ4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP1R13BQ96KQ4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP1R13BQ96KQ4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP1R13BQ96KQ4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP1R13BQ96KQ4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP1R13BQ96KQ4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP1R13BQ96KQ4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP1R13BQ96KQ4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP1R13BQ96KQ4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP1R13BQ96KQ4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP1R13BQ96KQ4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP1R13BQ96KQ4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP1R13BQ96KQ4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms