Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GJD4Q96KN9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GJD4Q96KN9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GJD4Q96KN9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GJD4Q96KN9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GJD4Q96KN9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GJD4Q96KN9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GJD4Q96KN9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GJD4Q96KN9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GJD4Q96KN9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GJD4Q96KN9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GJD4Q96KN9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GJD4Q96KN9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
GJD4Q96KN9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GJD4Q96KN9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GJD4Q96KN9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GJD4Q96KN9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GJD4Q96KN9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GJD4Q96KN9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GJD4Q96KN9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GJD4Q96KN9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GJD4Q96KN9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GJD4Q96KN9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GJD4Q96KN9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GJD4Q96KN9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GJD4Q96KN9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
GJD4Q96KN9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GJD4Q96KN9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GJD4Q96KN9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GJD4Q96KN9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GJD4Q96KN9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GJD4Q96KN9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GJD4Q96KN9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GJD4Q96KN9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
GJD4Q96KN9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
GJD4Q96KN9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
GJD4Q96KN9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
GJD4Q96KN9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
GJD4Q96KN9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
GJD4Q96KN9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GJD4Q96KN9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GJD4Q96KN9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GJD4Q96KN9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
GJD4Q96KN9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GJD4Q96KN9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
GJD4Q96KN9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GJD4Q96KN9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GJD4Q96KN9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GJD4Q96KN9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GJD4Q96KN9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GJD4Q96KN9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GJD4Q96KN9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GJD4Q96KN9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
GJD4Q96KN9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GJD4Q96KN9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GJD4Q96KN9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GJD4Q96KN9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GJD4Q96KN9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GJD4Q96KN9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GJD4Q96KN9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GJD4Q96KN9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GJD4Q96KN9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
GJD4Q96KN9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GJD4Q96KN9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GJD4Q96KN9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GJD4Q96KN9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GJD4Q96KN9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GJD4Q96KN9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GJD4Q96KN9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GJD4Q96KN9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GJD4Q96KN9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GJD4Q96KN9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GJD4Q96KN9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GJD4Q96KN9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GJD4Q96KN9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GJD4Q96KN9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GJD4Q96KN9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GJD4Q96KN9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GJD4Q96KN9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GJD4Q96KN9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GJD4Q96KN9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GJD4Q96KN9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms