Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PKNOX2Q96KN3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PKNOX2Q96KN3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKNOX2Q96KN3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms