Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EAF1Q96JC9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms