Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRIG1Q96JA1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms